在好友風間徹（真柴摩利 配音）的邀請之下，野原新之助（小林由美子 配音）、妮妮（林玉緒 配音）、阿呆（佐藤智惠 配音）和正男（一龍齋貞友 配音）來到了名叫“天下春日部學院”的超級精英學校中進行為期一周的體驗入學，風間希望自己能夠通過這一周的優秀表現來獲得這所學校的入學資格。...

某日，小新（矢島晶子 配音）在街上遇見了一只黑色的小狗，因為它和小白猶如一個模子里刻出來一般相像，小新將它取名“小黑”，帶回了家。之后，一位名叫普莉林的美麗女子出現在小新的面前，普莉林告訴小新，他是被選中的勇者，黑暗世界庫萊頓的大門已經打開，若小新再不行動，整個世界就將要被卷入陰謀和毀滅之中。...

雙葉幼兒園的游園會快到了，往年都會在游園會里跳春日部舞，但今年松阪老師卻突然提議要跳森巴，不過馬上受到吉永老師和上尾老師的大力反對，最終也只好不了了之。奇怪的是，第二天在幼兒園里，吉永老師卻不同前一晚的態度，大力向園長建議游園會上應該跳熱情的森巴……...

某日，雙葉幼稚園的孩子們正在船屋里愉快的玩耍，一位名叫美色（三石琴乃 配音）的神秘人物忽然現身，緊接著，一艘巨大的飛船將船屋整個抓了起來，來不及逃跑的風間（真柴摩利 配音）和小新（矢島晶子 配音）等人和飛船一起消失在了空中。...

美好的周末假期，野原新之助（矢島晶子 配音）和爸爸廣志（藤原啟治 配音）一起去看機器人的科幻電影，走出電影后的父子倆興奮地大玩合體游戲，誰知廣志卻不慎扭傷了腰。忍受不了老婆的碎碎念，廣志去醫院看病，可是周末醫院休診，父子倆只得來到公園休息，結果還被媽媽團趕了出去。當父子倆走在回家路上的時候，色色的廣志被一家按摩店的美女招待員所吸引，于是把小新打發回家，自己則跟著對方進入店里。從昏迷中醒來的廣志以飛...

新的一年，小新一家決定離開生活了多年的地方，舉家前往墨西哥。在新的國度，小新一家遇到了很多新奇的人和事，同時也遭遇到了仙人掌怪物的襲擊，小新不得不肩負起了保衛家人的重擔。...

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小新一家還有風間，妮妮，正男，阿呆一起報名動感超人周年紀念南海之旅，就在動感超人電影的船上首映會上，突然出現了一群粗暴的猴子將大人們都擄走了。春日部防衛隊為了救出大人們而出動，小新一行人冒險渡海到南海上的一座荒島希望可以查出發生了什么事，但本應在船上小葵和小白竟突然出現，小新還發現另一輛古怪的船.........

故事講述住在諾斯特拉達姆斯鄰鎮的努斯特拉達馬斯留下了一個預言：“在 20 和 23 并列的年份，天上會降下兩道光芒。一道是黑暗之光，另一道是小小的白光……不久，黑暗之光就會擁有強大的力量，擾亂和平，給世界帶來巨大的混亂。”...